研究报告

油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析  

郭栋1,2,3 , 张艳阳3 , 杜媚3 , 周宝元1 , 高卓晗1,3 , 赵明1* , 袁卉馥3*
1 中国农业科学院作物科学研究院, 北京, 100081; 2 东北农业大学农学院, 哈尔滨, 150030; 3 河北北方学院农林科技学院, 张家口, 075000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年12月11日    接受日期: 2019年01月23日    发表日期: 2020年04月30日
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摘要

超氧化物歧化酶(SOD)是重要的抗氧酶,在生物体内广泛存在。以油菜基因数据库为搜索平台,通过对油菜超氧化物歧化酶基因家族进行生物信息学分析。结果表明:油菜 SOD 基因家族主要含有 32 个基因,蛋白质的氨基酸序列长度 86 aa~386 aa 之间。BanSODs 基因具有相对保守的结构,即包含 SOD DNA 结构域;HMA DNA 结构域;Mn/N DNA 结构域;Mn/C DNA 结构域,SOD 蛋白结构中含有 7 螺旋和 4 折叠结构域。进化树分析表明油菜 SOD 蛋白序列与谷子、小立碗藓蛋白序列具有相对较高的同源性。该研究结果可以为进一步了解油菜 SOD 基因家族和玉米抗氧化机制提供一定参考。

关键词
油菜(Brassica napus);超氧化物歧化酶;基因家族

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《分子植物育种》印刷版
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